Sección Topográfica de Baleares dependiente del Servicio Geográfico del Ejército se encontraba en la Rambla de las Flores (antigua Via Roma) y disponía de diferentes departamentos si bien con pocos soldados.
En 1842 con la creación del Estado Mayor se normaliza el estudio de geodesia y cartografía para jefes y oficiales. En 1847 se aprobó el reglamento del Depósito, que lo articulaba en dos secciones, una de geografía y topografía y la otra de historia y estadística militar.
A partir de entonces y con diferentes reorganizaciones se definieron trabajos de gran relevancia como la publicación en ocho tomos del Itinerario descriptivo militar de España (1867), inicio del mapa militar de España a escala 1:100.000 (1920) y de Marruecos.
Tras la guerra civil, el 22 de septiembre de 1939 se creó el Servicio Geográfico y Cartográfico del Ejército y en 1941 la Escuela de Geodesia y Topografía del Ejército.
En 1944 se reorganizó la Brigada Obrera y Topográfica de Estado Mayor, que en 1959 pasaría a denominarse Agrupación Obrera y Topográfica del Servicio Geográfico.
En base al nuevo reglamento de cartografía militar, en 1968 el Servicio Geográfico del Ejército realizó de nuevo toda la cartografía militar de España.
En 1993 como consecuencia de la implantación progresiva de la política cartográfica de la OTAN y de la necesidad de disponer de una base de datos geográfica, se inicia la formación de las nuevas series OTAN correspondientes al territorio nacional, a escala 1:50.000, empleando técnicas asistidas por ordenador en todos los procesos.
En 1998 se cambia la denominación tradicional de Servicio Geográfico por la nueva de Centro Geográfico del Ejército (CEGET).

La Unidad ha participado en misiones internacionales Líbano (2007 y 2008), Afganistán (2008), Mali y Congo (2014)
Campañas antárticas 1987-2008: Base antártica española "Gabriel de Castilla"

Cuartel relacionado: Cuartel Alfonso X (Madrid)
Agrupación Obrera y Topográfica del Servicio Geográfico del Ejército AOT