El museo se encuentra dentro de la Base Naval de Ferrol en el edificio conocido como Presidio San Campio construido en 1770 de estilo barroco neoclásico. Fue inaugurado el 5 de marzo de 1986 con la misión de acercar la unión de Ferrol con la Armada por ello entre sus fondos se encuentran los restos de la fragata Santa María Magdalena de 1773, del buque-escuela Galatea y el del navío San Carlos Real de España, el Atlas Marítimo de España de Tofiño, parte del pecio del galeón San Gerónimo, una pieza de artillería de la fragata Nuestra Señora de las Mercedes así como otros elementos de artillería, torpedos, instrumentos náuticos de valor histórico y otras piezas