El cuartel de Lepanto donde estubo el Regimiento Infantería Mecanizada La Reina 2 hasta su traslado a la Base Cerro Muriano, el Centro Militar de Farmacia de la Defensa, la Farmacia Militar y unos pabellones de viviendas formaban un conjunto arquitectónico militar en el barrio de Levante. El cuartel construido en 1877 pasó a propiedad del ayuntamiento a finales de los 90 sin embargo la Farmacia se mantuvo en funcionamiento unos años más; actualmente a 2021 sus instalaciones están abandonadas en espera de un acuerdo de Defensa con el ayuntamiento.

El Centro Militar de Farmacia de la Defensa (CEMILFARDEF) se encuentra en la Base Logística de San Pedro al mando de un coronel. Hasta 2016 estaba distribuido en Madrid, Córdoba y Burgos quedando unificados en la Base San Pedro cuando sus nuevas instalaciones quedaron inauguradas el 20 de octubre de 2015 si bien se mantiene como destacamento la de Burgos con una pequeña producción farmacéutica.

Es de utilidad pública sin ánimo de lucro; fabrica, almacena y distribuye material farmacéutico para las FF.AA.,antídotos NRBQ, y según reza en su misión "del conjunto de la población española si se detuviese la producción de medicamentos debido a alguna emergencia sanitaria provocada por un conflicto internacional, un desastre natural o una pandemia"

La Inspeccion General de Sanidad de la Defensa está dirigida por un general de división del Cuerpo Militar de Sanidad cuya misión es gestionar los apoyos sanitarios, logisticos y operativos en cuanto a la red sanitaria militar y el apoyo farmacéutico, veterinario y psicológico que le encomienden el Jefe de Estado Mayor de la Defensa y de los Jefes de Estado Mayor del Ejército de Tierra, de la Armada y del Ejército del Aire.