Entre los principales puertos de este archipiélago podemos citar: el de Joló, entre las puntas de Dinangapit y Belán al NO., el de Luban al SE., el de Piniungan al SO., y el seno de Cabuncut al S.

Joló, situado en la isla de este nombre, fué la antigua residencia de los sultanes. Un muro de ladrillo lo rodea, constituyéndólo plaza fuerte los baluartes Alfonso XII, Puerta España; y los fuertes de Torre de la Reina y Princesa de Asturias, levantados en una colina no muy lejos le sirven de atalaya, al par que de defensa. Dependían de él los tres destacamentos arriba mencionados, los cuales constituían otras tantas comandancias político-militares.