En 1900 quedó constituida la Compañía Regional de Zapadores Minadores de Canarias con personal procedente de Sevilla con la misión de fortificar la ciudad de Las Palmas, cuatro años después quedaron creadas una Compañía de Zapadores y otra de Telégrafos.
Tras varias reorganizaciones y cambios de denominación llega a la Guerra Civil como Grupo Mixto de Ingenieros nº4 (Zapadores) en Las Palmas y nº3 (Transmisiones) en Tenerife, participando en diferentes acciones en la península en Toledo, Belchite, Burgo de Osma,Teruel, Balaguer, etc.
En 1950 se unifican ambos Grupos en Regimiento Mixto de Ingenieros de Canarias ubicándose en Tenerife.
En 1966 se reorganiza como Agrupación Mixta de Ingenieros de Canarias distribuyendose la Plana Mayor y el Batallón Mixto de Ingenieros XV en Tenerife y el Batallón XVI en el Acuartelamiento La Isleta en Las Palmas, organizados cada Batallón en dos Compañías una de Zapadores y otra de Transmisiones.
En 1980 las dos Compañías de Transmisiones se integran en el recien creado Batallón de Transmisiones Canarias.
En 2002 ambos Batallones se integran en uno al mando de un comandante si bien manteniendo sus dos acuartelamientos, el XV en La Cuesta, Tenerife y el XVI en La Isleta, Las Palmas, cuyo nombre de 1986 es el de Capitán Alcaide.
En 2005 la Compañía de Transmisiones de segrega de la Unidad pasando a depender del Batallón de Cuartel General de la Jefatura de Tropas de Canarias y adopta el nombre de Compañía de Transmisiones nº16 quedando en 2008 integrada en la Brigada de Infantería Ligera "Canarias XVI".