El 10 de febrero de 1956 la Academia Militar de Suboficiales quedó transformada en Academia Auxiliar Militar con la misión realizar cursos para la Escala de Suboficiales y la Escala Auxiliar.

En 1974 queda establecida la desaparición progresiva de la Escala Auxiliar creándose la Escala Básica de Suboficiales y la Escala Especial de Jefes y Oficiales del Ejército de Tierra.
El 14 de octubre de 1978 cambia la denominación a Academia Especial Militar con una nueva reorganización con la misión de organizar y desarrollar cursos para los miembros de la Escala Auxiliar y Escala Especial (enseñanzas comunes, especialidades, música, ascensos, ingresos a AGM, etc.)

Los suboficiales procedentes de la Academia General Básica de Suboficiales, podían ascender a tenientes tras superar diferentes pruebas si bien existía una gran escasez de plazas frente al alto número de solicitudes.
En la AGBS tenían dos años teóricos y uno de prácticas, seis años de experiencia como suboficial, un año en la AEM y otro en las Academias de Armas y Cuerpos.
Tras un mínimo de 8 años de teniente y superados los cursos correspondientes podían ascender a Capitán y con la misma equiparación a los de la Escala Activa a través de la AGM, el resto de ascensos posibles.
Los suboficiales procedentes de la Escala Especial padecían una importante dificultad para los ascensos en comparación con la Escala Activa.

En la actualidad las instalaciones que se encuentran en la carretera de Andalacía, km. 10 son el Cuartel de San Cristobal donde se encuentra el Parque y Centro de Abastecimiento de Material de Intendencia.